Efter att en smitta utrotat närmare 98% av barnen i USA, utvecklar de resterande överlevande 2% av barnen övernaturliga krafter och placeras i bestraffningsläger. När en 16-årig tjej rymmer från sitt läger, ansluter hon sig till en grupp andra tonåringar som är på flykt från regeringen. "The Darkest Minds" är baserad på den välkända bokserien skriven av Alexandra Bracken.